tag:blogger.com,1999:blog-43350831538224616252023-11-16T11:43:06.401+01:00La Microbiología en la WebSEMicrobiologiahttp://www.blogger.com/profile/06169788081873506498noreply@blogger.comBlogger17125tag:blogger.com,1999:blog-4335083153822461625.post-8064838293999023302013-04-05T10:28:00.002+02:002013-04-05T10:28:28.855+02:00Nuestra Ciencia: Cómo buscar una función en una librería metagenómica<a href="http://www.nature.com/srep/2013/130122/srep01107/carousel/srep01107-f1.jpg" imageanchor="1" ><img border="0" src="http://www.nature.com/srep/2013/130122/srep01107/carousel/srep01107-f1.jpg" /></a>
<div align="justify">
<br />
Las librerías metagenómicas son librerías de genes construidas con todo el ADN que se
aísla de una muestra ambiental. Su mayor ventaja es que permiten obtener una inmensa
cantidad de información genética independientemente de nuestra capacidad de cultivar
los microorganismos presentes en la muestra. La identificación de los genes se hace por
secuenciación masiva y comparación con las bases de datos.
<br /><br />
Estas librerías metagenómicas también se pueden analizar desde un punto de vista
funcional, es decir, identificando la función de los genes. Esto se puede hacer analizando
las nuevas funciones (nuevo fenotipo) que confieren las secuencias genómicas de la librería
en una bacteria huésped. Sin embargo, una limitación importante de esta estrategia es que
la detección depende de la eficacia de la expresión de los genes clonados en la bacteria
huésped. De hecho, se ha demostrado que la mayoría de los genes normalmente no se
expresan en una bacteria huésped.
<br /><br />
En un original trabajo publicado en <i>Scientific Reports</i> se describe un nuevo método para
mejorar el análisis funcional de las librerías metagenómicas. Para ello han construido unos
vectores y cepas que combinan el empleo de <i>E. coli</i> como cepa huésped especializada para la
transcripción de ADN metagenómico con dos nuevos vectores de expresión que incorporan
componentes genéticos virales. Uno de ellos se basa en la ARN-polimerasa del fago T7 que
no reconoce la mayoría de las señales de terminación de la transcripción bacteriana. El
otro sistema de expresión se basa en el empleo de la proteína N anti-terminación del fago
λ combinado con un sistema regulador bacteriano inducible.
<br /><br />
El trabajo incluye también un "prueba de concepto" del nuevo sistema. Para ello, han
construido una librería metagenómica extrayendo el ADN total de una muestra tomada de la
costa de Punta San García (Cádiz) contaminada con petróleo por un vertido. El objetivo era
encontrar genes relacionados con la resistencia al antibiótico beta-lactámico carbenicilina.
De aproximadamente unos 54.000 clones que formaban la librería, sólo seis de ellos
portaban genes que conferían resistencia a dicho antibiótico. La secuenciación de estos seis
clones seleccionados demostró la existencia de genes que codifican para beta-láctamasas o
bombas tipo <i>efflux</i>, responsables del fenotipo de resistencia a la carbenicilina. Los resultados
por tanto demuestran la validez del nuevo sistema de expresión.
<br /><br />
Esta tecnología de metagenómica funcional es una herramienta muy poderosa que puede
permitir descubrir nuevos productos naturales y enzimas de interés biotecnológico.
<br /><br />
Resumen realizado por:<br />
Ignacio López-Goñi<br />
Departamento de Microbiología y Parasitología<br />
Universidad de Navarra<br />
<br /><br />
<br /><br />
<span style="float: left; padding: 5px;"><a href="http://www.researchblogging.org"><img alt="ResearchBlogging.org" src="http://www.researchblogging.org/public/citation_icons/rb2_large_gray.png" style="border:0;"/></a></span>
<br /><br /><span class="Z3988" title="ctx_ver=Z39.88-2004&rft_val_fmt=info%3Aofi%2Ffmt%3Akev%3Amtx%3Ajournal&rft.jtitle=Scientific+reports&rft_id=info%3Apmid%2F23346364&rfr_id=info%3Asid%2Fresearchblogging.org&rft.atitle=Heterologous+viral+expression+systems+in+fosmid+vectors+increase+the+functional+analysis+potential+of+metagenomic+libraries.&rft.issn=&rft.date=2013&rft.volume=3&rft.issue=&rft.spage=1107&rft.epage=&rft.artnum=&rft.au=Terr%C3%B3n-Gonz%C3%A1lez+L&rft.au=Medina+C&rft.au=Lim%C3%B3n-Mort%C3%A9s+MC&rft.au=Santero+E&rfe_dat=bpr3.included=1;bpr3.tags=Biology%2CMetagenomics%2C+%2C+Microbiology+%2C+Molecular+Biology">Terrón-González L, Medina C, Limón-Mortés MC, & Santero E (2013). Heterologous viral expression systems in fosmid vectors increase the functional analysis potential of metagenomic libraries. <span style="font-style: italic;">Scientific reports, 3</span> PMID: <a rev="review" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/23346364">23346364</a></span>
<br /><br />
</div>SEMicrobiologiahttp://www.blogger.com/profile/06169788081873506498noreply@blogger.com0tag:blogger.com,1999:blog-4335083153822461625.post-6713541662255800912013-03-04T10:41:00.002+01:002013-03-04T10:41:40.184+01:00Nuestra ciencia: Evolución de Pseudomonas syringae y genes de producción de mangotoxina<div class="separator" style="clear: both; text-align: center;">
<a href="https://blogger.googleusercontent.com/img/b/R29vZ2xl/AVvXsEhrgOXxhY0kkb7fO7QpEaCjnY9iKkB54MViT2GXRSKDxSTE9pqlT3i-frp4Ta7503ltxqPPjt0z_sjuFOuLUEqhbmfBpM3Ul1AMLdqZ3VtyuwzvOdBjag5EiZ3sC70nJ7qx31L9AgxpO8bB/s1600/mbo-operon.jpg" imageanchor="1" style="margin-left: 1em; margin-right: 1em;"><img border="0" height="83" src="https://blogger.googleusercontent.com/img/b/R29vZ2xl/AVvXsEhrgOXxhY0kkb7fO7QpEaCjnY9iKkB54MViT2GXRSKDxSTE9pqlT3i-frp4Ta7503ltxqPPjt0z_sjuFOuLUEqhbmfBpM3Ul1AMLdqZ3VtyuwzvOdBjag5EiZ3sC70nJ7qx31L9AgxpO8bB/s400/mbo-operon.jpg" width="400" /></a></div>
<br />
<div align="justify">
<br />
<br />
<i>Pseudomonas syringae</i> es una bacteria epifítica patógena de muchas plantas a las que causa frecuentemente enfermedades graves y de gran repercusión económica en agricultura. Se han descrito al menos 50 patovariedades en relación al rango de plantas a las que provoca lesiones en hojas o en frutos. Esta especie secreta diversos efectores a través del sistema de secreción de tipo III (T3S); uno de ellos, la mangotoxina, inhibidor de la ornitina N-acetil transferasa, fue detectado por primera vez en <i>P. syringae</i> pv. syringae. Curiosamente, el operón <i>mbo</i>, esencial para la producción de mangotoxina, puede ser usado en estudios filogenéticos. En estudios previos se observó una gran concomitancia entre los genes "housekeeping" <i>gyrB</i> y <i>rpoD</i> y dos de los componentes del T3S por lo que se piensa que la adquisición del T3S fue anterior a la diversificación de <i>P. syringae</i> en las distintas patovariedades.
<br />
<br />
Estudios realizados por este grupo de investigadores empleando cebadores específicos del operón <i>mbo</i> y con 98 cepas de <i>P. syringae</i> detectaron este operón en 52 cepas productoras de mangotoxina y en otras 7 no productoras, pero no pudieron amplificar en otras 35 no productoras. Esto junto con el análisis de algunos genomas, ha revelado que el operón <i>mbo</i> se encuentra limitado a 5 patovariedades todas pertenecientes a la genomoespecie (grupo de cepas con una relación ADN-ADN mayor del 70% y con 5º o menos de Δ Tm) 1. Además, el operón <i>mbo</i> mantiene sintenia y está inserto en la misma localización genómica que mantiene una alta conservación de secuencia en las zonas alrededor del punto de inserción. Estos resultados les permite sugerir que el operón de la biosíntesis de la mangotoxina fue adquirido por transferencia horizontal y una sola vez en la evolución de esta especie.
<br />
<br />
Resumen realizado por:
M. Rosario Espuny (espuny@us.es)
Departamento de Microbiología. <br />
Facultad de Biología.<br />
Universidad de Sevilla.
<br />
<br />
<span style="float: left; padding: 5px;"><a href="http://www.researchblogging.org/"><img alt="ResearchBlogging.org" src="http://www.researchblogging.org/public/citation_icons/rb2_large_gray.png" style="border: 0px currentColor;" /></a></span>
<br />
<br />
<span class="Z3988" title="ctx_ver=Z39.88-2004&rft_val_fmt=info%3Aofi%2Ffmt%3Akev%3Amtx%3Ajournal&rft.jtitle=Applied+and+Environmental+Microbiology&rft_id=info%3Adoi%2F10.1128%2FAEM.03007-12&rfr_id=info%3Asid%2Fresearchblogging.org&rft.atitle=The+Mangotoxin+Biosynthetic+Operon+%28mbo%29+Is+Specifically+Distributed+within+Pseudomonas+syringae+Genomospecies+1+and+Was+Acquired+Only+Once+during+Evolution&rft.issn=0099-2240&rft.date=2012&rft.volume=79&rft.issue=3&rft.spage=756&rft.epage=767&rft.artnum=http%3A%2F%2Faem.asm.org%2Fcgi%2Fdoi%2F10.1128%2FAEM.03007-12&rft.au=Carrion%2C+V.&rft.au=Gutierrez-Barranquero%2C+J.&rft.au=Arrebola%2C+E.&rft.au=Bardaji%2C+L.&rft.au=Codina%2C+J.&rft.au=de+Vicente%2C+A.&rft.au=Cazorla%2C+F.&rft.au=Murillo%2C+J.&rfe_dat=bpr3.included=1;bpr3.tags=Biology%2CMicrobiology%2C+evolution">Carrion, V., Gutierrez-Barranquero, J., Arrebola, E., Bardaji, L., Codina, J., de Vicente, A., Cazorla, F., & Murillo, J. (2012). The Mangotoxin Biosynthetic Operon (mbo) Is Specifically Distributed within Pseudomonas syringae Genomospecies 1 and Was Acquired Only Once during Evolution <span style="font-style: italic;">Applied and Environmental Microbiology, 79</span> (3), 756-767 DOI: <a href="http://dx.doi.org/10.1128/AEM.03007-12" rev="review">10.1128/AEM.03007-12</a></span><br />
<br />
<br /></div>
SEMicrobiologiahttp://www.blogger.com/profile/06169788081873506498noreply@blogger.com1tag:blogger.com,1999:blog-4335083153822461625.post-41113352529680811652013-03-01T09:49:00.003+01:002013-03-01T09:54:59.773+01:00Nuestra Ciencia: Los premios Nobel y la Microbiología. Dos nacimientos coetáneos que marcaron el desarrollo y la visibilidad de la ciencia en el siglo XX <div class="separator" style="clear: both; text-align: center;">
<a href="https://blogger.googleusercontent.com/img/b/R29vZ2xl/AVvXsEjqFw4lP44m3s5q_hCP5k8UXhj7VEFzkyTPimPguBE_0uFBkA187AeiZ12jEVLt0_N3jbi_0uYfDh78S2WqYF9Rd6b2qQKFYFQaKiEiX-BAFQog-1K0uiVggliJVVoGdT8kJT1zxJYIE40u/s1600/Hist-Microbiologos.jpg" imageanchor="1" style="margin-left: 1em; margin-right: 1em;"><img border="0" height="242" src="https://blogger.googleusercontent.com/img/b/R29vZ2xl/AVvXsEjqFw4lP44m3s5q_hCP5k8UXhj7VEFzkyTPimPguBE_0uFBkA187AeiZ12jEVLt0_N3jbi_0uYfDh78S2WqYF9Rd6b2qQKFYFQaKiEiX-BAFQog-1K0uiVggliJVVoGdT8kJT1zxJYIE40u/s400/Hist-Microbiologos.jpg" width="400" /></a></div>
<br />
<div align="justify">
El nacimiento de los premios Nobel en los comienzos del siglo XX coincidió con lo que se denomina la edad de oro de la Microbiología, en la que se sentaron las bases del conocimiento de los microorganismos y de las herramientas fundamentales para su estudio.
<br />
<br />
Durante la primera década de su existencia (1901-1910) el premio Nobel de Fisiología o Medicina recayó en seis microbiólogos. Casi todos ellos relacionados con los laboratorios fundados por Louis Pasteur y Robert Koch. Este último fue uno de los premiados (1905) después de una carrera investigadora extensa e intensa. A él le debemos el concepto de "cultivo puro" y en su laboratorio se desarrollaron técnicas y métodos de trabajo todavía hoy vigentes para el cultivo de microorganismos (el uso del agar-agar, las placas de Petri y otros). Desarrolló algunas de las tinciones más importantes en bacteriología y describió las esporas bacterianas y su elevada resistencia. Pero su mayor contribución fue formular los postulados propuestos por Jacob Henle para demostrar la implicación de un microorganismo en una enfermedad infecciosa. La aplicación de los postulados de Koch-Henle llevó la microbiología a su zénit, permitiendo la descripción de los agentes causales específicos de muchas enfermedades contagiosas.
<br />
<br />
Además de Koch, otros cinco microbiólogos fueron galardonados con el Nobel en la primera década del siglo XX. Emil A. von Behring (1901) fue premiado por el desarrollo de la inmunoterapia (terapia sérica). Demostró que la capacidad para resistir frente la difteria (y otras enfermedades) residía en la parte no celular de la sangre (el suero), trabajo que desarrolló junto con el japonés S. Kitasato. Al año siguiente (1902) Ronald Ross recibió el Nobel por su estudio de la malaria. Describió el papel del mosquito Anopheles en la transmisión y en el ciclo biológico del parásito. También en el campo de los protozoos parásitos trabajaba Charles L. A. Laveran que fue premiado en 1907. Los últimos microbiólogos premiados en la década fueron Ilya Metchnikov y Paul Ehrlich (1908). Ambos trabajaron en diferentes aspectos de la respuesta a la infección, aunque Ehrlich se considera el padre de la quimioterapia por el desarrollo de compuestos con actividad antimicrobiana y baja toxicidad celular (salvarsán), mientras que la contribución más relevante de Metchnikov fue sin duda la teoría general de la fagocitosis.
<br />
<br />
Resumen realizado por:<br />
<b>Mª Francisca Colom</b><br />
Dpto. de Producción vegetal y Microbiología<br />
Universidad Miguel Hernández<br />
Facultad de Medicina<br />
Sant Joan d’Alacant 03550. Alicante<br />
colom@umh.es<br />
<br />
<br />
Artículo original:
<br />
<b>Juan-Carlos Argüelles</b>.
<br />
<i><a href="http://www.hekint.org/the-early-days-of-the-nobel-prize.html">The early days of the Nobel Prize and Golden Age of Microbiology</a></i>. <br />
Hektoen International. 2013 5(1).
</div>
SEMicrobiologiahttp://www.blogger.com/profile/06169788081873506498noreply@blogger.com5tag:blogger.com,1999:blog-4335083153822461625.post-60000624948780595652013-01-16T10:58:00.001+01:002013-01-16T10:58:17.521+01:00Nuestra ciencia: Entendiendo cómo produce daños neurológicos la malaria cerebral<div class="separator" style="clear: both; text-align: center;">
<a href="https://blogger.googleusercontent.com/img/b/R29vZ2xl/AVvXsEjiIh04TxmC1vZ5GUROM6oTrKuZYe2e6liw_BhCbxy8Q68E0xYkRSOY5WGrB-WV-fjIUN5Yu3_eibmZOEHne834iDUMXBWQxZuPUrKYLWChLTNSSNuU-vfpIaeOZTo-I_mnwyev2vdRuXo7/s1600/MalariaCerebral.png" imageanchor="1" style="margin-left:1em; margin-right:1em"><img border="0" height="252" width="320" src="https://blogger.googleusercontent.com/img/b/R29vZ2xl/AVvXsEjiIh04TxmC1vZ5GUROM6oTrKuZYe2e6liw_BhCbxy8Q68E0xYkRSOY5WGrB-WV-fjIUN5Yu3_eibmZOEHne834iDUMXBWQxZuPUrKYLWChLTNSSNuU-vfpIaeOZTo-I_mnwyev2vdRuXo7/s320/MalariaCerebral.png" /></a></div>
<br /><br />
<div align="justify">
La malaria cerebral es la más importante enfermedad parasitaria que afecta al sistema nervioso central y es la causa del 80% de las muertes de los casos de malaria. Los que sobreviven suelen padecer secuelas neurocognitivas: memoria, lenguaje, visión, ataxia,… durante largos periodos, lo cual es mucho más preocupante en pacientes infantiles.
<br /><br />
La causa de esas secuelas neurocognitivas que se observan en niños no es bien conocida. Se piensa que el parásito provoca una obstrucción microvascular y que dispara una respuesta inflamatoria exacerbada que provocaría esos daños neuronales. En el desarrollo cerebral el factor neurotrófico derivado de cerebro (BDNF) es un importante regulador de la sinaptogénesis, la plasticidad sináptica y la supervivencia neuronal, por lo que dicho factor podría jugar un papel en el mantenimiento de la integridad del sistema nervioso central en el caso de padecer malaria cerebral.
<br /><br />
Investigadores de la Universidad Complutense han utilizado un modelo animal para estudiar la malaria cerebral y el papel del BDNF en la recuperación del sistema nervioso central. Para ello han utilizado ratones de la cepa C57BL/6 y los han infectado con Plasmodium berghei. Han observado que la progresión del daño neurológico en los cerebros de los ratones infectados se puede definir en cuatro etapas.
<br /><br />
Inicialmente se observa un incremento en todas las regiones del cerebro de la expresión de marcadores de inflamación y de moléculas de adhesión: ICAM-1, VCAM-1, e-selectina y p-selectina. Posteriormente se observa la acumulación de glóbulos rojos parasitados. Las señales inmunológicas provocan que el proteosoma celular sea modificado y se transforme en un inmunoproteosoma, lo que causa que el reciclaje de las proteínas cerebrales se vea alterado, lo que puede conducir a un malfuncionamiento celular.
<br /><br />
Según aumenta la severidad de los síntomas, se observa que la cantidad de mRNA de BDNF disminuye en varias regiones cerebrales. Primero en el tálamo-hipotálamo, luego el cerebelo, el tallo cerebral y finalmente el cortex. La disminución también se observa en otras importantes proteínas cerebrales como la llamada NCAM o proteína de adhesión neuronal. Esa disminución se correlaciona con el desarrollo de la cuarta etapa de la secuencia de la enfermedad y con la severidad de los síntomas.
<br /><br />
Los autores apuntan que el control de la expresión de BDNF y de NCAM podría ser una buena diana terapéutica para modificar e incluso revertir los daños neurológicos causados por la malaria cerebral.
<br /><br />
Resumen realizado por:<br />
Manuel Sánchez <br />
Profesor Contratado Doctor <br />
Departamento de Producción Vegetal y Microbiología.<br /> Universidad Miguel Hernández
<br /><br />
<span style="float: left; padding: 5px;"><a href="http://www.researchblogging.org"><img alt="ResearchBlogging.org" src="http://www.researchblogging.org/public/citation_icons/rb2_large_gray.png" style="border:0;"/></a></span>
<br /><br /><span class="Z3988" title="ctx_ver=Z39.88-2004&rft_val_fmt=info%3Aofi%2Ffmt%3Akev%3Amtx%3Ajournal&rft.jtitle=Brain+Research&rft_id=info%3Adoi%2F10.1016%2Fj.brainres.2012.10.040&rfr_id=info%3Asid%2Fresearchblogging.org&rft.atitle=Brain-derived+neurotrophic+factor+and+the+course+of+experimental+cerebral+malaria&rft.issn=00068993&rft.date=2013&rft.volume=1490&rft.issue=&rft.spage=210&rft.epage=224&rft.artnum=http%3A%2F%2Flinkinghub.elsevier.com%2Fretrieve%2Fpii%2FS0006899312016976&rft.au=Linares%2C+M.&rft.au=Mar%C3%ADn-Garc%C3%ADa%2C+P.&rft.au=P%C3%A9rez-Benavente%2C+S.&rft.au=S%C3%A1nchez-Nogueiro%2C+J.&rft.au=Puyet%2C+A.&rft.au=Bautista%2C+J.&rft.au=Diez%2C+A.&rfe_dat=bpr3.included=1;bpr3.tags=Biology%2CImmunology%2C+Microbiology+%2C+Molecular+Biology%2C+Neurobiology">Linares, M., Marín-García, P., Pérez-Benavente, S., Sánchez-Nogueiro, J., Puyet, A., Bautista, J., & Diez, A. (2013). Brain-derived neurotrophic factor and the course of experimental cerebral malaria <span style="font-style: italic;">Brain Research, 1490</span>, 210-224 DOI: <a rev="review" href="http://dx.doi.org/10.1016/j.brainres.2012.10.040">10.1016/j.brainres.2012.10.040</a></span><br /><br />
</div>SEMicrobiologiahttp://www.blogger.com/profile/06169788081873506498noreply@blogger.com1tag:blogger.com,1999:blog-4335083153822461625.post-28250031591150380202013-01-15T09:42:00.001+01:002013-01-15T09:42:05.569+01:00Nuestra Ciencia:¿Qué pasa con los ácidos micólicos de las micobacterias atípicas?: que también estimulan alguna citoquinas importantes en la tuberculosis.<div class="separator" style="clear: both; text-align: center;">
<a href="https://blogger.googleusercontent.com/img/b/R29vZ2xl/AVvXsEgJwB4KY4OyVhebW_ScGYh9bcuqCs9z4x7bNVpovb1Eu3SriY6vqBFQqgeisTOk-bimQcLZEzlj6DHiS0NYQ1OzbQ2JzafzxtQwO3L_lc7CwV1lDhDi23CQSElijyVCD0kjD_dB7Auv-MIl/s1600/Cordfactors.jpg" imageanchor="1" style="margin-left:1em; margin-right:1em"><img border="0" height="222" width="320" src="https://blogger.googleusercontent.com/img/b/R29vZ2xl/AVvXsEgJwB4KY4OyVhebW_ScGYh9bcuqCs9z4x7bNVpovb1Eu3SriY6vqBFQqgeisTOk-bimQcLZEzlj6DHiS0NYQ1OzbQ2JzafzxtQwO3L_lc7CwV1lDhDi23CQSElijyVCD0kjD_dB7Auv-MIl/s320/Cordfactors.jpg" /></a></div>
<div align="justify">
<br /><br />
La bacteria <i>Mycobacterium</i> incluye los agentes de la tuberculosis (<i>Mycobacterium tuberculosis</i>) y de la lepra (<i>Mycobacterium leprae</i>), además de otros que son oportunistas y especies saprofíticas, las que se denominan micobacterias atípicas. <i>Mycobacterium</i> tiene una pared celular muy peculiar, cuya composición está relacionada con su patogenicidad. Por ejemplo, los ácidos micólicos son un tipo de ácidos grasos de cada larga típicos de <i>Mycobacterium</i> que suelen estar unidos a molécula de azúcares formando unos glucolípidos que se denomina factores "cord".
<br /><br />
Estos factores "cord" son lípidos con una gran actividad biológica que están relacionados con algunos efectos patológicos de la tuberculosis. Por ejemplo, los factores “cord” de <i>Mycobacterium tuberculosis</i> inducen la secreción de varios tipos de citoquinas, que modulan la actividad del sistema inmune del huésped. Los estudios sobre las propiedades biológicas de los factores “cord” de las mycobacterias atípicas son escasos. Por eso, un grupo de microbiólogos de las universidades <a href="http://www.um.es/web/genymicro/">de Murcia</a> y <a href="http://www.uab.es/servlet/Satellite/departament-de-genetica-i-de-microbiologia-1207025819581.html">Autónoma de Barcelona</a>, ha estudiado la capacidad de los factores “cord” de dos mycobacterias atípicas (<i>Mycobacterium alvei</i> y <i>Mycobacterium brumae</i>, aisladas de muestras de agua del rio Llobregat de Barcelona a principio de los años 90) de inducir la producción de citoquinas y la han comparado con el factor “cord” de <i>Mycobacterium tuberculosis</i> (cepa H37Rv).
<br /><br />
Para ello, lo primero que han hecho es aislar los factores "cord" de esta dos micobacterias atípicas y caracterizarlos mediante técnicas de NMR. Han comprobado que aunque su estructura química es muy similar entre sí y con el factor "cord" de <i>Mycobacterium tuberculosis</i>, existen algunas pequeñas modificaciones estructurales entre los tres. Luego, han estudiado la capacidad de estimular la producción de citoquinas de estos factores "cord" en dos modelos celulares in vitro distintos. Han empleado líneas celulares de macrófagos de ratón (RAW 264.7) y de monocitos humanos (THP-1). Los resultados demuestran que los factores "cord" de las tres micobacterias estimulan la producción de la interleuquina 6 en células de ratón, aunque con distinta intensidad. En las células humanas, el perfil de interleuquinas estimuladas es similar en las dos micobacterias atípicas, pero diferente del de <i>Mycobacterium tuberculosis</i>. En definitiva, el patrón de inducción de diferentes citoquinas pro-inflamatorias por los factores “cord” de las micobacterias atípicas es similar entre sí, pero tienen ciertas diferencias respecto al patrón de inducción del factor "cord" de <i>Mycobacterium tuberculosis</i>.
<br /><br />
Estos resultados sugieren por tanto que pequeños cambios en la estructura de los ácidos micólicos de los factores "cord" afectan a sus actividades biológicas. Futuros análisis podrían clarificar si estos factores "cord" de las micobacterias atípicas podrían ser empleados como estimuladores del sistema inmune o adyuvantes, así como su papel biológico en relación con la inmunología de la tuberculosis.
<br /><br />
Resumen realizado por:
<br /><b>Ignacio López-Goñi</b>
<br />Catedrático de Microbiología,
<br />Departamento de Microbiología y Parasitología, Universidad de Navarra
<br /><br />
<span style="float: left; padding: 5px;"><a href="http://www.researchblogging.org"><img alt="ResearchBlogging.org" src="http://www.researchblogging.org/public/citation_icons/rb2_large_gray.png" style="border:0;"/></a></span>
<br /><br />
<span class="Z3988" title="ctx_ver=Z39.88-2004&rft_val_fmt=info%3Aofi%2Ffmt%3Akev%3Amtx%3Ajournal&rft.jtitle=Microbiology+%28Reading%2C+England%29&rft_id=info%3Apmid%2F22977091&rfr_id=info%3Asid%2Fresearchblogging.org&rft.atitle=Cord+factors+from+atypical+mycobacteria+%28Mycobacterium+alvei%2C+Mycobacterium+brumae%29+stimulate+the+secretion+of+some+pro-inflammatory+cytokines+of+relevance+in+tuberculosis.&rft.issn=1350-0872&rft.date=2012&rft.volume=158&rft.issue=Pt+11&rft.spage=2878&rft.epage=85&rft.artnum=&rft.au=Linares+C&rft.au=Bernab%C3%A9u+A&rft.au=Luquin+M&rft.au=Valero-Guill%C3%A9n+PL&rfe_dat=bpr3.included=1;bpr3.tags=Biology%2CMicrobiology%2C+Biochemistry%2C+Immunology">Linares C, Bernabéu A, Luquin M, & Valero-Guillén PL (2012). Cord factors from atypical mycobacteria (Mycobacterium alvei, Mycobacterium brumae) stimulate the secretion of some pro-inflammatory cytokines of relevance in tuberculosis. <span style="font-style: italic;">Microbiology (Reading, England), 158</span> (Pt 11), 2878-85 PMID: <a rev="review" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/22977091">22977091</a></span>
<br /><br />
</div>SEMicrobiologiahttp://www.blogger.com/profile/06169788081873506498noreply@blogger.com1tag:blogger.com,1999:blog-4335083153822461625.post-82651389568821034912013-01-09T10:00:00.001+01:002013-01-09T10:29:48.654+01:00Nuestra ciencia: Como Bacillus subtilis "regala" copias de su DNA a sus compañeros<div class="separator" style="clear: both; text-align: center;">
<a href="https://blogger.googleusercontent.com/img/b/R29vZ2xl/AVvXsEgmz4ZGGVz_jlI1PNJbk09MgGlZMRzRDk9GppSb6JLSfPOER7ZLfIhbuadQYSmJMtbmWDYoUHQO035N1CN65HfAZli8slIAlwFjT0pbAzVD1HYPLwVhT61WSjZGOPGEllCXz1mPXyDCbTjc/s1600/Bacillusubtiliscolonias.jpg" imageanchor="1" style="margin-left:1em; margin-right:1em"><img border="0" height="143" width="430" src="https://blogger.googleusercontent.com/img/b/R29vZ2xl/AVvXsEgmz4ZGGVz_jlI1PNJbk09MgGlZMRzRDk9GppSb6JLSfPOER7ZLfIhbuadQYSmJMtbmWDYoUHQO035N1CN65HfAZli8slIAlwFjT0pbAzVD1HYPLwVhT61WSjZGOPGEllCXz1mPXyDCbTjc/s320/Bacillusubtiliscolonias.jpg" /></a></div>
<br /><br />
<div align="justify">
El equipo, formado por Olga Zafra, María Lamprecht y Carolina González, y dirigido por Eduardo González-Pastor, del Departamento de Evolución Molecular del Centro de Astrobiología, ha demostrado que una población de <i>Bacillus subtilis</i> es capaz de coordinar la liberación de DNA al medio y su captación por otros individuos de la población, lo cual es muy importante desde un punto de vista evolutivo.
<br /><br />
En ciencia no es raro que fenómenos que parecen ya explicados del todo revelen sorpresas cuando se miran con más detalle. Ese es el caso de los fenómenos de transferencia genética horizontal. Es decir, de cómo un microorganismo captura un fragmento de DNA que hay en el medio extracelular y lo mete en su interior, insertándolo en su genoma de tal forma que es capaz de expresar la información genética codificada en dicho DNA. El ejemplo más comentado es el caso de la transformación genética bacteriana con genes que codifican resistencias a los antibióticos.
<br /><br />
¿Cuál es el origen de dicho DNA extracelular? Generalmente se asume que proviene de células que han sido lisadas y han liberado su contenido al medio ambiente. Ese DNA vagará por el medio ambiente, y probablemente será destruido o degradado, pero en ocasiones puede provocar un fenómeno de transformación genética si es captado por una bacteria.
<br /><br />
En la bacteria <i>B. subtilis</i> también estaba descrito que en cultivos que se encontraban en la fase tardía de crecimiento exponencial se podían detectar cantidades apreciables de DNA extracelular. Lo que se suponía es que era debido a algún tipo de lisis de una subpoblación de las bacterias, pero lo que se han encontrado los investigadores del CAB es algo muy distinto.
<br /><br />
Resulta que las bacterias secretan DNA al medio de manera activa cuando se encuentran en la fase tardía de crecimiento exponencial. Los fragmentos secretados corresponden a todo el genoma del microorganismos, lo que indica que no hay una región cromosómica con preferencia para exportar sobre otra región del genoma. Y no solo eso, también son más susceptibles a captar DNA extracelular. Es lo que se conoce como estado de competencia para los fenómenos de transformación genética.
<br /><br />
El descubrimiento puede tener varias implicaciones para explicar diversas pautas evolutivas, sobre todo el papel de los fenómenos de transferencia horizontal en la aparición de nuevas especies microbianas. A nivel más práctico, podría ser muy útil para estudiar la dispersión de los genes de resistencia a los antibióticos y poder así poner un freno a dicho proceso tan importante desde el punto de vista de la salud pública.
<br /><br />
<br /><br />
Enlaces relacionados: Audio del programa "<a href="http://radio.umh.es/files/2012/12/191212-Programa-T%C3%9A-YO-Y-LOS-MICROBIOS.mp3">Tú, yo y los microbios</a>" emitido el pasado 19 de diciembre y dedicado a este artículo
<br /><br /><br />
<span style="float: left; padding: 5px;"><a href="http://www.researchblogging.org"><img alt="ResearchBlogging.org" src="http://www.researchblogging.org/public/citation_icons/rb2_large_gray.png" style="border:0;"/></a></span>
<br /><br />
<span class="Z3988" title="ctx_ver=Z39.88-2004&rft_val_fmt=info%3Aofi%2Ffmt%3Akev%3Amtx%3Ajournal&rft.jtitle=PloS+one&rft_id=info%3Apmid%2F23133654&rfr_id=info%3Asid%2Fresearchblogging.org&rft.atitle=Extracellular+DNA+release+by+undomesticated+Bacillus+subtilis+is+regulated+by+early+competence.&rft.issn=&rft.date=2012&rft.volume=7&rft.issue=11&rft.spage=&rft.epage=&rft.artnum=&rft.au=Zafra+O&rft.au=Lamprecht-Grand%C3%ADo+M&rft.au=de+Figueras+CG&rft.au=Gonz%C3%A1lez-Pastor+JE&rfe_dat=bpr3.included=1;bpr3.tags=Biology%2CMicrobiology%2C+Molecular+Biology%2C+%2C+Evolutionary+Biology%2C+Genetics">Zafra O, Lamprecht-Grandío M, de Figueras CG, & González-Pastor JE (2012). Extracellular DNA release by undomesticated Bacillus subtilis is regulated by early competence. <span style="font-style: italic;">PloS one, 7</span> (11) PMID: <a rev="review" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/23133654">23133654</a></span>
<br /><br />
<br /><br />
Resumen realizado por <br />
Manuel Sánchez
<br />Profesor Contratado Doctor
<br />Departamento de Producción Vegetal y Microbiología
<br /> Universidad Miguel Hernández
<br /><br />
</div>SEMicrobiologiahttp://www.blogger.com/profile/06169788081873506498noreply@blogger.com2tag:blogger.com,1999:blog-4335083153822461625.post-30949568797955214392012-12-28T11:22:00.000+01:002013-01-09T09:53:08.293+01:00Nuestra Ciencia: ¿Podemos controlar el riesgo de transmisión de Salmonella en alimentos a través de modelos matemáticos?<div class="separator" style="clear: both; text-align: center;">
<a href="http://ars.els-cdn.com/content/image/1-s2.0-S0963996912000361-gr1.jpg" imageanchor="1" style="margin-left:1em; margin-right:1em"><img border="0" height="235" width="375" src="http://ars.els-cdn.com/content/image/1-s2.0-S0963996912000361-gr1.jpg" /></a></div>
<br />
<br />
<div align="justify">
Existe una tendencia en la industria alimentaria a evitar tratamientos drásticos finales para
eliminar los microorganismos en los alimentos (alterantes o patógenos, como Salmonella). El
control de los microorganismos se lograría mediante la aplicación de tratamientos sucesivos
o combinados más leves (<i>hurdle technology</i>) que actúan como obstáculos (o barreras) que
la microbiota debe superar para comenzar a crecer. En estas condiciones de los alimentos,
las bacterias deben invertir sus energías en su mantenimiento (equilibrio homeostático)
en vez de en su crecimiento.
<br />
<br />
La microbiología predictiva consiste en el desarrollo de
modelos matemáticos de crecimiento/no crecimiento, que recojan los efectos individuales y
combinados de cada una de dichas barreras para confirmar el control microbiano alcanzado
mediante combinaciones de las mismas y poder así diseñar nuevos sistemas de control
eficaces. Sin embargo, los mecanismos de acción de cada tratamiento no son completamente
conocidos, lo que complica estos estudios.
<br />
<br />
Un grupo de investigación español ha publicado
una buena revisión de cinco de estos modelos de crecimiento/no crecimiento desarrollados
entre 2001 y 2011 y los ha comparado utilizando algunos de los factores de barrera implicados
(temperatura, pH y actividad de agua ) con dos puntos de corte en las probabilidad calculadas.
Esto les permite asignar un grado de conservadurismo a cada uno de los cinco modelos
analizados. Además, comentan las principales herramientas predictivas en microbiología
de alimentos (o modelos terciarios) incluyendo un software para modelaje de crecimiento/
no crecimiento (<i>Microbial Responses Viewer</i>). Por último, incluyen algunas advertencias
sobre este tipo de modelos matemáticos para que se tengan en cuenta en investigaciones
posteriores.
<br />
<br />
<span style="float: left; padding: 5px;"><a href="http://www.researchblogging.org"><img alt="ResearchBlogging.org" src="http://www.researchblogging.org/public/citation_icons/rb2_large_gray.png" style="border:0;"/></a></span>
<br />
<br />
<span class="Z3988" title="ctx_ver=Z39.88-2004&rft_val_fmt=info%3Aofi%2Ffmt%3Akev%3Amtx%3Ajournal&rft.jtitle=Food+Research+International&rft_id=info%3Adoi%2F10.1016%2Fj.foodres.2012.01.006&rfr_id=info%3Asid%2Fresearchblogging.org&rft.atitle=A+review+on+growth%2Fno+growth+Salmonella+models&rft.issn=09639969&rft.date=2012&rft.volume=47&rft.issue=1&rft.spage=90&rft.epage=99&rft.artnum=http%3A%2F%2Flinkinghub.elsevier.com%2Fretrieve%2Fpii%2FS0963996912000361&rft.au=Carrasco%2C+E.&rft.au=del+Rosal%2C+S.&rft.au=Racero%2C+J.&rft.au=Garc%C3%ADa-Gimeno%2C+R.&rfe_dat=bpr3.included=1;bpr3.tags=Biology%2CMicrobiology">Carrasco, E., del Rosal, S., Racero, J., & García-Gimeno, R. (2012). A review on growth/no growth Salmonella models <span style="font-style: italic;">Food Research International, 47</span> (1), 90-99 DOI: <a rev="review" href="http://dx.doi.org/10.1016/j.foodres.2012.01.006">10.1016/j.foodres.2012.01.006</a></span>
<br />
<br />
<br />
Resumen realizado por:
<br />
<br />
Aitor Rementeria<br />
Profesor Titular<br />
Departamento de Inmunología, Microbiología y Parasitología<br />
Facultad de Ciencia yTecnología<br />
Universidad del País Vasco (UPV/EHU)<br />
</div>SEMicrobiologiahttp://www.blogger.com/profile/06169788081873506498noreply@blogger.com1tag:blogger.com,1999:blog-4335083153822461625.post-69692038752794683652012-12-20T09:58:00.001+01:002012-12-20T09:58:04.065+01:00Nuestra ciencia: Detectan una nueva estrategia fúngica de detoxificación de metales pesados <div class="separator" style="clear: both; text-align: center;">
<a href="https://blogger.googleusercontent.com/img/b/R29vZ2xl/AVvXsEh_5Lg42q9hWmJ-tlrtgxU68vmK9lu6ZhjK5klLSXT_caNynOCqm7NnKaahfVy6B-63IAf67m1DsAUo2ErO9vxOmATi0MEJ8YY9irbJ4rs26qny_L592lEFLbU2GvMGqHKMgUe8q-fYt9mT/s1600/Cobre_en_R_irregularis.jpg" imageanchor="1" style="margin-left: 1em; margin-right: 1em;"><img border="0" height="311" src="https://blogger.googleusercontent.com/img/b/R29vZ2xl/AVvXsEh_5Lg42q9hWmJ-tlrtgxU68vmK9lu6ZhjK5klLSXT_caNynOCqm7NnKaahfVy6B-63IAf67m1DsAUo2ErO9vxOmATi0MEJ8YY9irbJ4rs26qny_L592lEFLbU2GvMGqHKMgUe8q-fYt9mT/s320/Cobre_en_R_irregularis.jpg" width="311" /></a></div>
<div align="center">
<span style="font-size: x-small;">Detección de cobre en esporas de <i>R. irregularis</i>. En A y B se observa el interior de una espora expuesta durante 2 semanas a 500 μM Cu. En C y D se muestran los controles. Las fotos A y C son antes del tratamiento con ácido acético y ferrocianuro potásico. Las fotos B y D son fotos después de dicho tratamiento que permite revelar la acumulación de cobre gracias a un precipitado rojo
</span></div>
<br />
<br />
<div align="justify">
Aunque el cobre es un nutriente esencial de plantas y microorganismos, cuando este metal pesado se presenta en exceso en el suelo puede resultar tóxico para ellos. Los hongos que forman micorrizas arbusculares son simbiontes de las plantas terrestres y han co-evolucionado con ellas durante millones de años. Estos hongos simbiontes desarrollan una estructura de micelio extra-radical que aumenta la absorción de nutrientes minerales móviles como fósforo, nitrógeno, cobre o zinc por la planta, mejorando así su crecimiento. Esto podría ser peligroso si dichos componentes se encuentran en concentraciones muy superiores a las óptimas en el suelo. En una comunicación breve en la que participan investigadores españoles se presenta una nueva estrategia de los hongos arbusculares que podría aliviar esa toxicidad. El estudio detecta que al menos dos especies, <i>Claroideoglomus claroideum</i> (simbionte de la gramínea <i>Imperata condensata</i>), y <i>Rhizophagus irregularis</i>, (simbionte de raíces de zanahoria), son capaces de eliminar ese exceso de cobre en el suelo vehiculizándolo hacia el citoplasma de sus esporas reproductivas. No se conocen los componentes del hongo implicados en esa acumulación, pero su compartimentación en las mismas detoxifica este metal pesado. Como resultado, las esporas que acumulan cobre pierden su fertilidad, pero el hongo y posiblemente la planta sobreviven y crecen en suelos contaminados. Sería muy interesante conocer si otros hongos simbiontes presentan estrategias similares, si solo lo hacen con cobre o también con otros metales pesados y si este tipo de procesos podrían ser utilizados en la biorremediación de los suelos contaminados.
<br /><br/>
Resumen realizado por:
Aitor Rementeria
Profesor Titular
Departamento de Inmunología, Microbiología y Parasitología
Facultad de Ciencia yTecnología
Universidad del País Vasco (UPV/EHU)</div>
<br /><br/>
<br /><br/>
<span style="float: left; padding: 5px;"><a href="http://www.researchblogging.org"><img alt="ResearchBlogging.org" src="http://www.researchblogging.org/public/citation_icons/rb2_large_gray.png" style="border:0;"/></a></span>
<br /><br/>
<span class="Z3988" title="ctx_ver=Z39.88-2004&rft_val_fmt=info%3Aofi%2Ffmt%3Akev%3Amtx%3Ajournal&rft.jtitle=Soil+Biology+and+Biochemistry&rft_id=info%3Adoi%2F10.1016%2Fj.soilbio.2012.10.031&rfr_id=info%3Asid%2Fresearchblogging.org&rft.atitle=Copper+compartmentalization+in+spores+as+a+survival+strategy+of+arbuscular+mycorrhizal+fungi+in+Cu-polluted+environments&rft.issn=00380717&rft.date=2012&rft.volume=&rft.issue=&rft.spage=&rft.epage=&rft.artnum=http%3A%2F%2Flinkinghub.elsevier.com%2Fretrieve%2Fpii%2FS0038071712004105&rft.au=Cornejo%2C+P.&rft.au=P%C3%A9rez-Tienda%2C+J.&rft.au=Meier%2C+S.&rft.au=Valderas%2C+A.&rft.au=Borie%2C+F.&rft.au=Azc%C3%B3n-Aguilar%2C+C.&rft.au=Ferrol%2C+N.&rfe_dat=bpr3.included=1;bpr3.tags=Biology%2CMicrobiology%2C+Bioremediation">Cornejo, P., Pérez-Tienda, J., Meier, S., Valderas, A., Borie, F., Azcón-Aguilar, C., & Ferrol, N. (2012). Copper compartmentalization in spores as a survival strategy of arbuscular mycorrhizal fungi in Cu-polluted environments <span style="font-style: italic;">Soil Biology and Biochemistry</span> DOI: <a rev="review" href="http://dx.doi.org/10.1016/j.soilbio.2012.10.031">10.1016/j.soilbio.2012.10.031</a></span>
SEMicrobiologiahttp://www.blogger.com/profile/06169788081873506498noreply@blogger.com0tag:blogger.com,1999:blog-4335083153822461625.post-62431400491692933962012-12-13T13:06:00.000+01:002012-12-13T13:06:35.471+01:00Nuestra Ciencia: Metagenomas de la Albufera y del Mar Menor<div class="separator" style="clear: both; text-align: center;">
<a href="https://blogger.googleusercontent.com/img/b/R29vZ2xl/AVvXsEgdCWMnHG4jlzda69Q254F7UDX_f-3n-o8FJbhGda1oLZnoZXG_ByqtPIz8j0B8FjICTrHHRnoubfjy0-zYiJyADZqAAuijgw3jmO-BIVqUdNm5QSsheGEtO92lKI00mMvCAQIU-182DjP8/s1600/Metagenoma-Albufera-Marmenor.jpg" imageanchor="1" style="margin-left:1em; margin-right:1em"><img border="0" height="152" width="320" src="https://blogger.googleusercontent.com/img/b/R29vZ2xl/AVvXsEgdCWMnHG4jlzda69Q254F7UDX_f-3n-o8FJbhGda1oLZnoZXG_ByqtPIz8j0B8FjICTrHHRnoubfjy0-zYiJyADZqAAuijgw3jmO-BIVqUdNm5QSsheGEtO92lKI00mMvCAQIU-182DjP8/s320/Metagenoma-Albufera-Marmenor.jpg" /></a></div>
<br />
<br />
<div align="justify">
Una colaboración entre científicos del Instituto Craig Venter, la Universidad de Valencia y la Universidad Miguel Hernández han conseguido realizar el metagenoma de dos de los más representativos ecosistemas del Mediterráneo: la Albufera de Valencia y el Mar Menor de Murcia. De esa forma han comparado las especies microbianas presentes en un lago de costa de agua dulce muy eutrofizado y otro de agua salobre.
<br />
<br />
Las conclusiones del estudio han sido publicadas en la revista <i>Nature Scientific Reports</i>. En este trabajo se han obtenido más de un millón y medio de secuencias lo que ha permitido observar tanto patrones generales a ambas lagunas mediterráneas. como las diferencias en la composición microbiana que se encuentran entre dos nichos ecológicos tan diversos. Pero también se han encontrado con algunas sorpresas.
<br />
<br />
Por ejemplo, la Albufera presenta mucha más microdiversidad de lo que se creía pese a que se trata de un ecosistema con altos niveles de contaminación y muy eutrofizado. Curiosamente no se han encontrado a los grupos bacterianos denominados Actinobacterias de bajo porcentaje GC y grupo LD12 de las alfaproteobacterias. Ambos grupos son muy importantes en los ecosistemas de agua dulce más estudiados hasta ahora. Una de las razones que explicarían dicha ausencia es que los representantes de ambos grupos son bacterias muy pequeñas y oligotróficas, con una razón superficie/volumen muy elevada. Eso las colocaría en desventaja frente a especies más grandes y de mayor crecimiento, adaptadas a condiciones hipertróficas. Según Antonio Camacho investigador del Instituto Cavanilles de Biodiversidad y Biología Evolutiva del Parque Científico de la Universidad de Valencia - "Eso permite aventurar que dicho ecosistema dispone de un mayor potencial para superar episodios de contaminación, puesto que los microorganismos pueden representar herramientas naturales para mejorar su calidad ecológica"
<br />
<br />
En cuanto al Mar Menor, a pesar de ser mucho más salino que el Mediterráneo, su microbiota es, en parte, parecida, aunque tiene características muy diferenciadas como, por ejemplo, la ausencia de <i>Prochlorococcus</i>, un procariota fotosintético muy común en los océanos del planeta y por supuesto en las aguas del Mediterráneo, que es sustituida por la cianobacteria <i>Synechococcus</i>. Aunque lo más llamativo ha sido encontrar que el microbio dominante del bacterioplacton en el Mar Menor es una Alfa-Proteobacteria, oxidante del azufre que era completamente desconocida.
<br />
<br />
También se ha estudiado la biodiversidad de los microorganismos eucariotas. Los datos de microscopía y de secuenciación del fitoplankton han mostrado que en ambos ecosistemas hay presencia de diatomeas, pero también hay diferencias. Así, los dinoflagelados son los que dominan en el Mar Menor, mientras que en la Albufera lo más abundantes son las algas clorofitas. En
<br />
<br />
Según Antonio Camacho, los resultados de la investigación "hacen cuestionarse algunas de las ideas preconcebidas sobre la teórica baja diversidad de los ecosistemas estresados o, incluso, permiten hacer vínculos entre teorías establecidas para el mundo macroscópico y su extrapolación al mundo microbiano”. El conocimiento de la composición de la microbiota de estos ecosistemas puede ser útil para facilitar su recuperación ecológica, “pero también tiene un indudable potencial biotecnológico"
</div>
<br />
<br />
Resumen basado en la noticia aperecida en la <a href="http://www.agenciasinc.es/Noticias/Describen-por-primera-vez-el-metagenoma-microbiano-completo-de-la-Albufera-y-del-Mar-Menor">Agencia SINC</a> realizado por:
<br />
<br />
Manuel Sánchez
Profesor Contratado Doctor
Departamento de Producción Vegetal y Microbiología
Universidad Miguel Hernández
<br />
<br />
<br />
Enlaces relacionados: Audio emitido el pasado 27 de noviembre en el programa "<b><a href="http://podcastmicrobio.blogspot.com.es/2012/12/metagenomica-de-la-albufera-y-del-mar.html">Tú, yo y los microbios</a></b>" de Radio UMH.
<br />
<br />
<span style="float: left; padding: 5px;"><a href="http://www.researchblogging.org/"><img alt="ResearchBlogging.org" src="http://www.researchblogging.org/public/citation_icons/rb2_large_gray.png" style="border: 0;" /></a></span>
<br />
<br />
<span class="Z3988" title="ctx_ver=Z39.88-2004&rft_val_fmt=info%3Aofi%2Ffmt%3Akev%3Amtx%3Ajournal&rft.jtitle=Scientific+reports&rft_id=info%3Apmid%2F22778901&rfr_id=info%3Asid%2Fresearchblogging.org&rft.atitle=Metagenomes+of+Mediterranean+coastal+lagoons.&rft.issn=&rft.date=2012&rft.volume=2&rft.issue=&rft.spage=490&rft.epage=&rft.artnum=&rft.au=Ghai+R&rft.au=Hernandez+CM&rft.au=Picazo+A&rft.au=Mizuno+CM&rft.au=Ininbergs+K&rft.au=D%C3%ADez+B&rft.au=Valas+R&rft.au=DuPont+CL&rft.au=McMahon+KD&rft.au=Camacho+A&rft.au=Rodriguez-Valera+F&rfe_dat=bpr3.included=1;bpr3.tags=Biology%2CEvolutionary+Biology%2C+Genetics%2C+Microbiology%2C+Biochemistry%2C+Biotechnology%2C+Ecology%2C+Marine+Biology%2C+Molecular+Biology">Ghai R, Hernandez CM, Picazo A, Mizuno CM, Ininbergs K, Díez B, Valas R, DuPont CL, McMahon KD, Camacho A, & Rodriguez-Valera F (2012). Metagenomes of Mediterranean coastal lagoons. <span style="font-style: italic;">Scientific reports, 2</span> PMID: <a href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/22778901" rev="review">22778901</a></span>
<br />
<br />SEMicrobiologiahttp://www.blogger.com/profile/06169788081873506498noreply@blogger.com0tag:blogger.com,1999:blog-4335083153822461625.post-58950295665624817002012-11-07T11:26:00.003+01:002012-11-07T11:27:45.732+01:00Nuestra Ciencia. Tropezando dos, y más veces, en la misma piedra: el delicado equilibrio del ecosistema de las pinturas rupestres<div class="separator" style="clear: both; text-align: center;">
<a href="http://pubs.acs.org/appl/literatum/publisher/achs/journals/content/esthag/2012/esthag.2012.46.issue-7/es2040625/production/images/medium/es-2011-040625_0003.gif" imageanchor="1" style="margin-left:1em; margin-right:1em"><img border="0" height="375" width="500" src="http://pubs.acs.org/appl/literatum/publisher/achs/journals/content/esthag/2012/esthag.2012.46.issue-7/es2040625/production/images/medium/es-2011-040625_0003.gif" /></a></div>
<br /><br />
<div align="justify">
El delicado equilibrio ambiental de las cuevas prehistóricas se ve alterado por las
continuas visitas originadas por su gran interés turístico con el consiguiente riesgo para sus pinturas rupestres. Martín-Sánchez y colaboradores han realizado entre 2008 y
2011 un estudio del microbioma fúngico de la cueva de Lascaux (Francia), con el fin
de observar el efecto de los tratamientos biocidas con una mezcla de fungicidas, que
incluye cloruro de benzalconio, aplicados para eliminar las manchas negras aparecidas
en techos y paredes.
<br /><br />
Como muestran sus datos, la vida se adapta a las presiones selectivas ambientales que encuentra. Los tratamientos antifúngicos aplicados fueron ineficaces, detectándose una mayor variabilidad en la microbiota de dichas manchas negras en 2009, probablemente colonizadas por propágulos de hongos aerovagantes.En 2010 y 2011, se observó la selección de levaduras negras resistentes, de los géneros <i>Exophiala</i>, <i>Ochroconis</i> y <i>Acremonium</i>, que supuso un cambio permanente en dicho ecosistema. Lo mismo había ocurrido con un tratamiento previo similar con cloruro de
benzalconio contra <i>Fusarium solani</i> en 2001, que seleccionó la microbiota responsable de las manchas negras, con una nueva especie principal <i>Ochroconis lascauxensis</i>.
<br /><br />
Los conservadores de estas cuevas intentan mitigar los efectos deletéreos del turismo y
mantener esta importante fuente de riqueza, pero las actuaciones de protección no
han sido siempre las más adecuadas. La experiencia indica que si se utilizan sustancias de control biológico de forma indiscriminada, se seleccionan microorganismos que podrían ser responsables de nuevos problemas. Sería deseable realizar estudios mucho más cuidadosos en el futuro de las ventajas y desventajas antes de comenzar un control biológico. Si no, volveremos a repetir los mismos errores.
<br /><br />
Resumen realizado por:
Aitor Rementeria (Profesor Titular) y Guillermo Quindós (Catedrático)
Departamento de Inmunología, Microbiología y Parasitología
Universidad del País Vasco (UPV/EHU)
<br /><br />
<span style="float: left; padding: 5px;"><a href="http://www.researchblogging.org"><img alt="ResearchBlogging.org" src="http://www.researchblogging.org/public/citation_icons/rb2_large_gray.png" style="border:0;"/></a></span>
<br /><br />
<span class="Z3988" title="ctx_ver=Z39.88-2004&rft_val_fmt=info%3Aofi%2Ffmt%3Akev%3Amtx%3Ajournal&rft.jtitle=Environmental+science+%26+technology&rft_id=info%3Apmid%2F22380699&rfr_id=info%3Asid%2Fresearchblogging.org&rft.atitle=Use+of+biocides+for+the+control+of+fungal+outbreaks+in+subterranean+environments%3A+the+case+of+the+Lascaux+Cave+in+France.&rft.issn=0013-936X&rft.date=2012&rft.volume=46&rft.issue=7&rft.spage=3762&rft.epage=70&rft.artnum=&rft.au=Martin-Sanchez+PM&rft.au=Nov%C3%A1kov%C3%A1+A&rft.au=Bastian+F&rft.au=Alabouvette+C&rft.au=Saiz-Jimenez+C&rfe_dat=bpr3.included=1;bpr3.tags=Biology%2CMicrobiology">Martin-Sanchez PM, Nováková A, Bastian F, Alabouvette C, & Saiz-Jimenez C (2012). Use of biocides for the control of fungal outbreaks in subterranean environments: the case of the Lascaux Cave in France. <span style="font-style: italic;">Environmental science & technology, 46</span> (7), 3762-70 PMID: <a rev="review" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/22380699">22380699</a></span>
<br /><br />
</div>SEMicrobiologiahttp://www.blogger.com/profile/06169788081873506498noreply@blogger.com0tag:blogger.com,1999:blog-4335083153822461625.post-25328686754319430462012-10-26T14:26:00.002+02:002012-10-26T14:35:28.570+02:00Nuestra Ciencia: Los bacteriófagos, una herramienta de control de Salmonella en producción aviar<div class="separator" style="clear: both; text-align: center;">
<a href="https://blogger.googleusercontent.com/img/b/R29vZ2xl/AVvXsEjFNg4ByPlgCePg2qdCq4aOVsJKOD2Oc59VxSxnMxSM20070-wVXq0PD189kqZE3PPkHKMwemHxNXLGL92Cm5u4ntLI_Eg65J7qDfOAL5d-QvmGSMh6_xd7CYDfgV52xn7FnBbirv0yBXA1/s1600/Pollos-UAB.jpg" imageanchor="1" style="margin-left:1em; margin-right:1em"><img border="0" height="320" width="184" src="https://blogger.googleusercontent.com/img/b/R29vZ2xl/AVvXsEjFNg4ByPlgCePg2qdCq4aOVsJKOD2Oc59VxSxnMxSM20070-wVXq0PD189kqZE3PPkHKMwemHxNXLGL92Cm5u4ntLI_Eg65J7qDfOAL5d-QvmGSMh6_xd7CYDfgV52xn7FnBbirv0yBXA1/s320/Pollos-UAB.jpg" /></a></div>
<br /><br />
<div align="justify">
<i>Salmonella</i> sigue siendo la principal causa de enfermedades transmitidas por alimentos en todo el mundo, siendo las aves el principal reservorio de esta bacteria zoonótica. La Unión Europea ha centrado sus esfuerzos en la reducción de la prevalencia de <i>Salmonella</i> en las granjas de producción aviar para contribuir a disminuir su incidencia a través de la cadena alimentaria (<i>from farm to fork</i>). En este sentido, el uso de los bacteriófagos presenta muchas ventajas. Investigadores del grupo de Microbiología Molecular de la Universitat Autònoma (UAB) de Barcelona han obtenido resultados destacables en la reducción de la colonización del tracto intestinal de pollos de engorde por <i>Salmonella</i>.
<br /><br />
<div class="separator" style="clear: both; text-align: center;">
<a href="https://blogger.googleusercontent.com/img/b/R29vZ2xl/AVvXsEhJBjbcvL0cW2I48UcTv9H5ZTo3E5SDJGGNoQEwmBNMCGdCDqwhH9kTTPQeRQ6O6QI9q04kKeYF37rPik2fuZVSZ0993iD3oRCcuRAFzAg6BrqTiD8ZdhJxVrRKi8cyfRRQ-qUAYXWfK6of/s1600/Fagos-UAB.jpg" imageanchor="1" style="margin-left:1em; margin-right:1em"><img border="0" height="179" width="320" src="https://blogger.googleusercontent.com/img/b/R29vZ2xl/AVvXsEhJBjbcvL0cW2I48UcTv9H5ZTo3E5SDJGGNoQEwmBNMCGdCDqwhH9kTTPQeRQ6O6QI9q04kKeYF37rPik2fuZVSZ0993iD3oRCcuRAFzAg6BrqTiD8ZdhJxVrRKi8cyfRRQ-qUAYXWfK6of/s320/Fagos-UAB.jpg" /></a></div>
<br /><br />
En el trabajo, publicado recientemente en la revista <i>Applied and Environmental Microbiology</i>, se presenta la caracterización tres bacteriófagos virulentos específicos de <i>Salmonella</i>: UAB_Phi20, UAB_Phi87 (en la imagen de arriba) y UAB_Phi78; seleccionados de entre los de la colección de bacteriófagos del Grupo de investigación, y el estudio de su capacidad para reducir la concentración de <i>Salmonella</i> en dos modelos animales de experimentación, utilizando diferentes pautas de tratamiento. El genoma de los tres bacteriófagos, que pertenecen al orden <i>Caudovirales</i>, no presentó homología con ningún gen conocido implicado en virulencia bacteriana. Los resultados <i>in vitro</i> obtenidos con un cóctel integrado por los tres bacteriófagos muestran su eficacia en la disminución de la concentración de una gran variedad de cepas de las serovariedades <i>Salmonella enterica Typhimurium</i> y <i>Salmonella enterica Enteritidis</i>, las más preocupantes en cuanto a seguridad alimentaria. Además, los tres bacteriófagos fueron relativamente estables a pH 2, resultado que sugiere que deben ser capaces de resistir en gran medida el tránsito a través del estómago hasta llegar al intestino de los animales.
<br /><br />
En el modelo de ratón, la administración del cóctel de bacteriófagos comportó una supervivencia del 50% de los animales infectados experimentalmente con <i>Salmonella</i>. Asimismo, en el modelo de pollos White Leghorn, libres de patógenos específicos (SPF), la mayor disminución de <i>Salmonella</i> en el intestino de los animales a lo largo del tiempo se obtuvo al administrar el cóctel un día antes (o justo después de la infección por <i>Salmonella</i>) y sucesivas readministraciones en días posteriores.
<br /><br />Los resultados obtenidos son los primeros en los que se muestra la eficacia de un cóctel de bacteriófagos en la reducción de <i>Salmonella</i> en pollos de hasta 25 días y también que se requiere un tratamiento frecuente de los animales, siendo crítica la administración de bacteriófagos antes de la infección por Salmonella, para lograr una reducción efectiva de esta bacteria a lo largo del tiempo.
<br /><br />Este trabajo forma parte de la tesis de la Dra. Carlota Bardina, presentada a finales del 2011 y la Universitat Autònoma de Barcelona ha solicitado una patente europea y la PCT correspondiente.
<br /><br /></div>
Resumen y fotografías realizadas por los propios miembros del grupo investigador
<br /><br />
<br /><br /><span style="float: left; padding: 5px;"><a href="http://www.researchblogging.org"><img alt="ResearchBlogging.org" src="http://www.researchblogging.org/public/citation_icons/rb2_large_gray.png" style="border:0;"/></a></span><br /><br /><span class="Z3988" title="ctx_ver=Z39.88-2004&rft_val_fmt=info%3Aofi%2Ffmt%3Akev%3Amtx%3Ajournal&rft.jtitle=Applied+and+environmental+microbiology&rft_id=info%3Apmid%2F22773654&rfr_id=info%3Asid%2Fresearchblogging.org&rft.atitle=Significance+of+the+bacteriophage+treatment+schedule+in+reducing+Salmonella+colonization+of+poultry.&rft.issn=0099-2240&rft.date=2012&rft.volume=78&rft.issue=18&rft.spage=6600&rft.epage=7&rft.artnum=&rft.au=Bardina+C&rft.au=Spricigo+DA&rft.au=Cort%C3%A9s+P&rft.au=Llagostera+M&rfe_dat=bpr3.included=1;bpr3.tags=Biology%2CMicrobiology%2C+Virology">Bardina C, Spricigo DA, Cortés P, & Llagostera M (2012). Significance of the bacteriophage treatment schedule in reducing Salmonella colonization of poultry. <span style="font-style: italic;">Applied and environmental microbiology, 78</span> (18), 6600-7 PMID: <a rev="review" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/22773654">22773654</a></span><br /><br />
SEMicrobiologiahttp://www.blogger.com/profile/06169788081873506498noreply@blogger.com0tag:blogger.com,1999:blog-4335083153822461625.post-16468184109756741662012-10-24T13:57:00.003+02:002012-10-24T13:57:52.468+02:00Nuestra ciencia: Sistema Toxina-antitoxina en Streptomyces<div class="separator" style="clear: both; text-align: center;">
<a href="http://www.plosone.org/article/fetchObject.action?uri=info:doi/10.1371/journal.pone.0032977.g001&representation=PNG_I" imageanchor="1" style="margin-left:1em; margin-right:1em"><img border="0" height="271" width="320" src="http://www.plosone.org/article/fetchObject.action?uri=info:doi/10.1371/journal.pone.0032977.g001&representation=PNG_I" /></a></div>
<br />
<br />
<div align="justify">
Los sistemas toxina-antitoxina de bacterias suelen estar compuestos por un par de genes contiguos que actúan de manera conjunta: uno de ellos codifica para una proteína con un efecto tóxico mientras que el otro gen codifica para la correspondiente proteína antídoto que bloquea la acción de la toxina. Estos sistemas se clasifican en tres tipos según cómo la antitoxina neutraliza la toxina. Los más frecuentes son los denominados de tipo II, en los que la toxina es inactivada al unirse con la antitoxina. Las toxinas suelen ser muy resistentes a las proteasas, mientras que las antitoxinas tienen una vida media mucho más corta por ser mucho más sensibles. Su función no está muy clara, aunque se han relacionado con la protección contra ADN extraño, la respuesta al estrés o la muerte celular programada. Han sido muy estudiados en bacterias Gram negativas como <i>Escherichia coli</i> en la que se han identificado al menos 33 sistemas toxina-antitoxina. Suelen estar presentes en plásmidos, por lo que se transmiten entre la población bacteriana con facilidad.
<br />
<br />
Recientemente, mediante análisis bioinformáticos de genomas completos se han detectado hasta 24 sistemas toxina-antitoxina en <i>Streptomyces</i>, aunque su funcionalidad no ha sido demostrada hasta ahora. Ahora, el <a href="http://www.usal.es/webusal/node/1352">Instituto de Biología Funcional y Genómica de la Universidad de Salamanca</a>, acaba de publicar en <a href="http://www.plosone.org/article/info%3Adoi%2F10.1371%2Fjournal.pone.0032977">PLoS ONE</a> la primera demostración experimental de uno de estos sistemas toxina-antitoxina funcional en dos especies de <i>Streptomyces</i>. El sistema, similar a uno de <i>E. coli</i>, está compuesto por una proteína YefM que actúa como antitoxina inestable, y por YoeB, que es la toxina estable. La sobre-expresión del sistema YefM/YoeB es letal tanto para <i>E. coli</i> como para de <i>Streptomyces</i>, lo que demuestra que el sistema es funcional. Además, el complejo proteico YefM/YoeB purificado interacciona y se une específicamente a determinadas secuencias promotoras, inhibiendo el inicio de la traducción.
<br />
<br />
Resumen realizado por:
<br /><br />
Ignacio López-Goñi<br />
Catedrático de Microbiología<br />
Departamento de Microbiología y Parasitología<br />
Universidad de Navarra<br />
<br /><br />
<br />
<br />
<span style="float: left; padding: 5px;"><a href="http://www.researchblogging.org"><img alt="ResearchBlogging.org" src="http://www.researchblogging.org/public/citation_icons/rb2_large_gray.png" style="border:0;"/></a></span>
<br />
<br />
<span class="Z3988" title="ctx_ver=Z39.88-2004&rft_val_fmt=info%3Aofi%2Ffmt%3Akev%3Amtx%3Ajournal&rft.jtitle=PloS+one&rft_id=info%3Apmid%2F22431991&rfr_id=info%3Asid%2Fresearchblogging.org&rft.atitle=Identification+of+the+first+functional+toxin-antitoxin+system+in+Streptomyces.&rft.issn=&rft.date=2012&rft.volume=7&rft.issue=3&rft.spage=&rft.epage=&rft.artnum=&rft.au=Sevillano+L&rft.au=D%C3%ADaz+M&rft.au=Yamaguchi+Y&rft.au=Inouye+M&rft.au=Santamar%C3%ADa+RI&rfe_dat=bpr3.included=1;bpr3.tags=Biology%2CMicrobiology%2C+Biochemistry">Sevillano L, Díaz M, Yamaguchi Y, Inouye M, & Santamaría RI (2012). Identification of the first functional toxin-antitoxin system in Streptomyces. <span style="font-style: italic;">PloS one, 7</span> (3) PMID: <a rev="review" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/22431991">22431991</a></span>
</div>SEMicrobiologiahttp://www.blogger.com/profile/06169788081873506498noreply@blogger.com0tag:blogger.com,1999:blog-4335083153822461625.post-62144209854761015102012-10-22T17:30:00.000+02:002012-10-24T14:12:54.617+02:00Nuestra Ciencia: ¿Qué les pasa a las levaduras cuándo les falta el potasio?<div class="separator" style="clear: both; text-align: center;">
<a href="https://blogger.googleusercontent.com/img/b/R29vZ2xl/AVvXsEiXO-sT-FaZm_lp6dgUb0NG0vGfYManFkxFSXFym-qEP-XjutyghM_LAAQUviTPtB4hNP9Ra9p5q-W4d-maXaKjpX4NVin-IebV4B_kOl5tRq4nPkoIUPzlQldsu8YnaCUbJaWI4PBMxVZI/s1600/levaduras-KCl.jpg" imageanchor="1" style="margin-left:1em; margin-right:1em"><img border="0" height="155" width="320" src="https://blogger.googleusercontent.com/img/b/R29vZ2xl/AVvXsEiXO-sT-FaZm_lp6dgUb0NG0vGfYManFkxFSXFym-qEP-XjutyghM_LAAQUviTPtB4hNP9Ra9p5q-W4d-maXaKjpX4NVin-IebV4B_kOl5tRq4nPkoIUPzlQldsu8YnaCUbJaWI4PBMxVZI/s320/levaduras-KCl.jpg" /></a></div>
<br /><br />
<div align="justify">
El potasio en uno de los cationes intracelulares más importantes para las células. La levadura <i>Saccharomyces cerevisiae</i> tiene en su membrana unos transportadores específicos para el potasio y, en condiciones normales, su concentración intracelular es de unos 200-300 mM. Aunque ya se sabe que el potasio es necesario para varias funciones celulares como la síntesis de proteínas y la activación de algunos enzimas, todavía no se han identificado todas las funciones que pueden estar relacionadas con este catión. El grupo de biología molecular de levaduras de la Universidad Autónoma de Barcelona, que dirige <a href="http://grupsderecerca.uab.cat/gbml/es/content/joaqu%C3%ADn-ari%C3%B1o">Joaquín Ariño</a>, acaba de publicar en <i>Environmental Microbiology</i> un artículo en el que estudian la respuesta de <i>S. cerevisiae</i> a la carencia de potasio. Para ello, han empleado un medio de cultivo que contiene solo trazas de potasio y han comparado la expresión de los genes de la levadura mediante tecnología DNA <i>microarray</i> en condiciones con y sin potasio a distintos tiempos. Los resultados demuestran que la carencia de potasio altera el perfil transcripcional de más de 1.700 genes (más del 25% del genoma completo de la levadura) cuya expresión es inducida o aumentada en algún momento de la investigación.
<br /><br />
La falta de potasio alteró drásticamente el metabolismo del azufre (disminuyendo la síntesis de los aminoácidos metionina y cisteína) y disparó una respuesta del tipo estrés oxidativo. Además, se interrumpió la expresión de los genes necesarios para la biogénesis del ribosoma y la traducción, y hubo una disminución en la expresión de diversos componentes necesarios para el control del ciclo celular (como algunas ciclinas y proteínas del tipo quinasas) y un bloqueo en el ensamblaje de las septinas. Este trabajo demuestra que ante la escasez de potasio, las levaduras responden alterando la expresión de varios de los genes que cubre diferentes aspectos de su biología, algunos de estos hasta ahora no explorados y que revelan nuevas funciones celulares de este catión.
<br /><br /><br /><br />
Resumen realizado por:
<br /><br />
Ignacio López-Goñi<br />
Catedrático de Microbiología<br />
Departamento de Microbiología y Parasitología<br />
Universidad de Navarra<br />
<br /><br />
<br /><br />
<span style="float: left; padding: 5px;"><a href="http://www.researchblogging.org"><img alt="ResearchBlogging.org" src="http://www.researchblogging.org/public/citation_icons/rb2_large_gray.png" style="border:0;"/></a></span>
<br /><br />
<span class="Z3988" title="ctx_ver=Z39.88-2004&rft_val_fmt=info%3Aofi%2Ffmt%3Akev%3Amtx%3Ajournal&rft.jtitle=Environmental+microbiology&rft_id=info%3Apmid%2F23039231&rfr_id=info%3Asid%2Fresearchblogging.org&rft.atitle=The+short-term+response+of+yeast+to+potassium+starvation.&rft.issn=1462-2912&rft.date=2012&rft.volume=&rft.issue=&rft.spage=&rft.epage=&rft.artnum=&rft.au=Barreto+L&rft.au=Canadell+D&rft.au=Valverde-Saub%C3%AD+D&rft.au=Casamayor+A&rft.au=Ari%C3%B1o+J&rfe_dat=bpr3.included=1;bpr3.tags=Biology%2CMicrobiology+%2C+Molecular+Biology">Barreto L, Canadell D, Valverde-Saubí D, Casamayor A, & Ariño J (2012). The short-term response of yeast to potassium starvation. <span style="font-style: italic;">Environmental microbiology</span> PMID: <a rev="review" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/23039231">23039231</a></span>
</div>
http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/j.1462-2920.2012.02887.x/abstract;jsessionid=59BF5AAC10A431D8FA4C21223CCFFC9D.d03t02
http://grupsderecerca.uab.cat/gbml/es/content/joaqu%C3%ADn-ari%C3%B1o
SEMicrobiologiahttp://www.blogger.com/profile/06169788081873506498noreply@blogger.com2tag:blogger.com,1999:blog-4335083153822461625.post-87853128020758923452012-10-21T18:37:00.000+02:002012-10-21T18:40:59.801+02:00Nuestra Ciencia: Enzibióticos y fagos: alternativas seguras a los antibióticos en el control y seguridad alimentaria<div class="separator" style="clear: both; text-align: center;">
<a href="http://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/4/4a/PhageExterior.svg/300px-PhageExterior.svg.png" imageanchor="1" style="margin-left:1em; margin-right:1em"><img border="0" height="366" width="300" src="http://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/4/4a/PhageExterior.svg/300px-PhageExterior.svg.png" /></a></div>
<br /><br />
<div align="justify">
Recientemente la famosa FDA (<i>Food and Drug Administration</i>) ha prohibido el uso del antibiótico cefalosporina para el engorde de ganado o de aves de granja. Con esta medida se pretende frenar el incremento de cepas resistentes a los antibióticos, uno de los principales problemas emergentes en el campo de la salud pública ya que la panoplia de antimicrobianos efectivos en el tratamiento de las infecciones está disminuyendo. Son muchos los grupos de investigación que buscan alternativas para tratar a esos patógenos tan peligrosos. En un reciente artículo que será publicado en el próximo número de <i>Microbiology Today</i> (http://www.sgm.ac.uk/pubs/micro_today) Patricia Veiga-Crespo y Tomas Villa resumen las iniciativas que se están llevando a cabo en el campo de la fagoterapia. Los primeros trabajos han sido realizados en acuicultura, biocontrol agrícola y medicina veterinaria. Así se han obtenido éxitos en el tratamiento de septicemias aviares y meningitis en terneros. La FDA ha permitido el uso de fagos en la producción de queso y vino, y también su uso en colirios y dentífricos. Otra estrategia es la de utilizar enzibioticos: enzimas líticas provenientes de fagos utilizadas como agentes antibacterianos. En este caso se está intentando mejorar su estabilidad y vida media así como comprobar que su posible actividad inmunogénica sea débil.
<br /><br />
Resumen realizado por:
<br /><br />
Manuel Sánchez
<br />
Profesor Contratado Doctor
<br />
Departamento de Producción Vegetal y Microbiología
<br />
Universidad Miguel Hernández
<br />
</div>SEMicrobiologiahttp://www.blogger.com/profile/06169788081873506498noreply@blogger.com2tag:blogger.com,1999:blog-4335083153822461625.post-55690510707420851152012-10-20T11:39:00.000+02:002012-10-21T17:56:45.383+02:00Nuestra Ciencia: ¿Es posible que en un futuro se pueda evitar la formación de las caries dentales con el consumo de microorganismos probióticos?<div align="justify">
Un grupo de investigación valenciano ha realizado un estudio del Microbioma oral humano mediante la secuenciación del metagenoma y los resultados aunque con datos muy preliminares así parece indicarlo, (<a href="http://www.nature.com/ismej/journal/v6/n1/full/ismej201185a.html">Belda-Ferre y cols. The oral metagenome in health and disease. The ISME Journal</a> (2012) 6, 46–56). La metagenómica es un campo nuevo de la Biología que consiste en la obtención de las secuencias genómicas de una comunidad microbiana extrayendo y analizando su ADN de forma global, obteniéndose así una instantánea que representa las especies presentes y sus actividades funcionales. Entre las comunidades microbianas a las que se está aplicando esta técnica, se encuentra lo que se conoce actualmente como Microbioma humano. En nuestro cuerpo, junto a nuestras propias células e interaccionando con ellas continuamente, existe un enorme número de microorganismos (en una proporción aproximada de 10:1) que conforma una comunidad microbiana, el Microbioma, característico de cada persona. Este Microbioma se ha llegado a considerar como un “órgano” del cuerpo humano, cuya influencia en nuestra salud y enfermedad puede ser muy importante.<br />
<br />
<br />
<div class="separator" style="clear: both; text-align: center;">
<a href="http://www.nature.com/ismej/journal/v6/n1/images/ismej201185f4.jpg" imageanchor="1" style="margin-left:1em; margin-right:1em"><img border="0" height="260" width="331" src="http://www.nature.com/ismej/journal/v6/n1/images/ismej201185f4.jpg" /></a></div>
<br />
<br />
En este interesante trabajo de investigación se ha realizado el estudio del Microbioma oral humano, con las técnicas de secuenciación del metagenoma. El estudio ha permitido conocer la composición y actividades funcionales del Microbioma en la salud y en la enfermedad demostrándose diferencias significativas entre personas enfermas, que sufren caries dental o problemas de gingivitis, e individuos sanos, que nunca han sufrido ninguno de estos procesos. Además, en este estudio se han aislado algunas de las especies bacterianas dominantes en individuos sanos, demostrándose así mismo su efecto inhibidor de bacterias cariogénicas, es decir productoras de caries dental. Aunque solo es un inicio que debe ser estudiado con mayor número de individuos que confirmen los resultados obtenidos por estos investigadores: ¿Puede el uso como probioticos de las bacterias seleccionadas aquí inhibir la formación de la caries dental?. Evidentemente solo es una idea aún no demostrada, y como investigador debería dudar, pero uno no puede evitar soñar en la erradicación de una de las enfermedades humanas más frecuentes, como es la caries dental.<br />
<br /></div>
Resumen realizado por:<br />
Aitor Rementeria<br />
Profesor Titular<br />
Departamento de Inmunología, Microbiología y Parasitología<br />
Facultad de Ciencia yTecnología<br />
Universidad del País Vasco (UPV/EHU)
<br />
<br />
<br />
<span style="float: left; padding: 5px;"><a href="http://www.researchblogging.org"><img alt="ResearchBlogging.org" src="http://www.researchblogging.org/public/citation_icons/rb2_large_gray.png" style="border:0;"/></a></span>
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<span class="Z3988" title="ctx_ver=Z39.88-2004&rft_val_fmt=info%3Aofi%2Ffmt%3Akev%3Amtx%3Ajournal&rft.jtitle=The+ISME+journal&rft_id=info%3Apmid%2F21716308&rfr_id=info%3Asid%2Fresearchblogging.org&rft.atitle=The+oral+metagenome+in+health+and+disease.&rft.issn=1751-7362&rft.date=2012&rft.volume=6&rft.issue=1&rft.spage=46&rft.epage=56&rft.artnum=&rft.au=Belda-Ferre+P&rft.au=Alcaraz+LD&rft.au=Cabrera-Rubio+R&rft.au=Romero+H&rft.au=Sim%C3%B3n-Soro+A&rft.au=Pignatelli+M&rft.au=Mira+A&rfe_dat=bpr3.included=1;bpr3.tags=Biology%2CMicrobiology+%2C+Molecular+Biology%2C+Taxonomy%2C+Metagenomics">Belda-Ferre P, Alcaraz LD, Cabrera-Rubio R, Romero H, Simón-Soro A, Pignatelli M, & Mira A (2012). The oral metagenome in health and disease. <span style="font-style: italic;">The ISME journal, 6</span> (1), 46-56 PMID: <a rev="review" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/21716308">21716308</a></span>
SEMicrobiologiahttp://www.blogger.com/profile/06169788081873506498noreply@blogger.com0tag:blogger.com,1999:blog-4335083153822461625.post-455535043688339422011-11-17T17:21:00.001+01:002011-11-17T19:58:38.325+01:00El dilema investigación-educación<div align="justify">En el muro Facebook de la SEM se hace referencia a un artículo publicado en <a href="http://www.plosbiology.org/article/info%3Adoi%2F10.1371%2Fjournal.pbio.1001174">PLoS Biology</a> cuyo título traducido sería: Integrando enseñanza e investigación en el laboratorio del Grado de Biología". Los autores han diseñado un cursillo práctico que al mismo tiempo que enseña a los estudiantes el método científico, les sirve a ellos para la recolección de datos. En el vídeo hacen un resumen del método.
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<div align="center"><iframe width="500" height="380" src="http://www.youtube.com/embed/ie3m5PqSPbk" frameborder="0" allowfullscreen></iframe></div>
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Está claro que la solución propuesta en el artículo es buena, aunque es cierto que no puede ser aplicada en algunas líneas de investigación. Yendo incluso un paso más allá, estoy convencido que ese tipo de curso sería casi imposible de implantar en cualquier universidad de nuestro país, pero no porque no existan proyectos en los cuales no pueda aplicarse dicha metodología, sino fundamentalmente por algo que los propios autores ya apuntan en el artículo: la falta de recursos materiales y humanos. Sin embargo me gustaría llamar la atención sobre una serie de frases que aparecen en la introducción de dicho artículo. Espero haberlas traducido correctamente.
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<i>El dilema: Un cientifico que trabaje en una universidad debe de encontrar un equilibrio entre el tiempo que dedica a la investigación y el tiempo que debe dedicar a la educación de los estudiantes... Sin embargo, en muchas universidades hay un desequilibrio en el que cada vez se dedica más tiempo, esfuerzo, prestigio y recursos a la investigación. Esto es a costa de la enseñanza de futuras generaciones de científicos o de educar científicamente a la ciudadanía... De hecho, el término “carga docente” indica que dicha actividad es algo que distrae esfuerzos y medios de lo realmente productivo...</i>
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Probablemente muchos coincidiremos en gran medida con las frases anteriores. Y sobre todo cuando nos encontramos en plena implantación del proceso Bolonia. Pero también es cierto que actualmente en los <i>curricula</i> pesa más la parte investigadora que la docente. Según la ANECA, para una persona que opte a ser titular de universidad, puede obtener hasta 50 puntos por investigación y hasta 40 por docencia. Para un catedrático los valores son 55 y 35 respectivamente. Así que parece que nos encontramos con una situación paradójica. Por un lado el proceso Bolonia implica una mayor dedicación a la docencia, por otro está menos valorada que la investigación.
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Por si fuera poco tenemos que añadir la actual situación de crisis, recortes y falta de medios. Sin ir más lejos, en la prensa alicantina de hoy ha aparecido <a href="http://www.diarioinformacion.com/alicante/2011/11/17/masificacion-falta-medios-frustran-plan-bolonia-universidad/1191678.html">una noticia</a> sobre lo que podría definirse como un "colapso a la boloñesa".
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El próximo mes de julio el <a href="http://www.ucm.es/info/mfar/ddm/">grupo D+DM se reunirá en Madrid</a> y probablemente trataremos este tema. Pero creo que este blog puede ser un buen foro para que comencemos a discutir alternativas, propuestas o soluciones que nos permitan enfrentarnos a dicha situación (¿seguir como estamos? ¿echar atrás Bolonia? ¿que la ANECA suba los puntos de docencia? ¿usar estudiantes de último curso como tutores? etc.). Así que, os animo a participar. Sólo necesitáis una cuenta google o similar y clickear en comentarios.
</div>Manuel Sánchezhttp://www.blogger.com/profile/07396779807112272697noreply@blogger.com6tag:blogger.com,1999:blog-4335083153822461625.post-71455176568522266032011-10-27T16:18:00.001+02:002011-10-27T17:01:34.438+02:00Bienvenidos<br />
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El <b><a href="http://www.semicrobiologia.org/ddm/index.php">Grupo Especializado en Docencia y Difusión</a></b> de la <a href="http://www.semicrobiologia.org/"><b>Sociedad Española de Microbiología</b></a> (D+DM SEM) abre este blog como una herramienta más para conseguir los siguientes objetivos:</div>
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- Recoger y difundir las noticias de interés microbiológico que han aparecido en los medios de comunicación de masas, y en su caso corregir o advertir sobre posibles errores e imprecisiones. Para ello cuenta con los blogs "<a href="http://noticiasmicrobiologicas.blogspot.com/"><b>La Microbiología en los Medios</b></a> y <b><a href="http://noticiasmicrobiologia.wordpress.com/">Noticias de microbiología</a></b>"</div>
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- Difundir los resultados más sobresalientes en el campo de la Microbiología.</div>
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- Promover en la web y las redes sociales las actividades divulgativas y educativas realizadas por los miembros de la SEM. Puedes seguirnos en <b><a href="http://www.facebook.com/SEMicrobiologia">Facebook</a></b> y en <b><a href="http://twitter.com/#!/SEMicrobiologia">Twitter</a></b></div>
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- Exponer y debatir propuestas de metodología docente para utilizarlas en la actual sociedad de la información</div>
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Si te interesa la Microbiología y su difusión ya sabes:</div>
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<a href="http://www.semicrobiologia.org/ddm/images/Animacion_apuntate.gif" imageanchor="1" style="margin-left: 1em; margin-right: 1em;"><img border="0" height="400" src="http://www.semicrobiologia.org/ddm/images/Animacion_apuntate.gif" width="400" /></a></div>SEMicrobiologiahttp://www.blogger.com/profile/06169788081873506498noreply@blogger.com0